專項檢查重點是招用農民工較多的建筑市政、交通、水利等建設施工企業以及加工制造、餐飲服務等中小型勞動密集型企業、個體工商戶，特別是政府投資工程項目建設施工企業及鋼鐵、煤炭等產能過剩行業等企業保障農民工工資支付情況。

通過專項檢查，要確保治欠保支工作取得明顯成效，實現春節前拖欠農民工工資案件和涉及人數明顯下降、因拖欠工資引發的群體性事件數量明顯下降，確保發生的拖欠農民工工資案件基本結案、群體性事件得到妥善處置、涉嫌拒不支付勞動報酬罪案件及時移交司法處理，切實維護廣大勞動者的工資報酬權益。

《通知》指出，專項檢查將分階段進行：一是集中宣傳和自查階段(2016年11月15日至30日)。二是執法檢查階段(2016年12月1日至2017年春節前)。

《通知》強調，嚴肅處理拖欠農民工工資問題。各地要建立清理欠薪工作臺賬，逐一落實欠薪企業、欠薪人數、欠薪金額，及時妥善處理欠薪問題或欠薪隱患，做到欠薪問題不解決絕不銷賬。

對存在拖欠工資問題的企業，人力資源社會保障部門要按照《勞動保障監察條例》有關規定，責令其限期改正；對拒不改正的，依法處以罰款；對涉嫌拒不支付勞動報酬犯罪的案件，要及時向公安機關移送。

對無故拖欠農民工工資數額大、時間長、性質惡劣的企業，在依法進行處理的同時，要按照《勞動保障監察條例》有關規定向社會公布并記入違法失信黑名單。對惡意拖欠農民工工資、情節嚴重的，還可依法責令停業整頓、降低或取消建筑施工企業資質，直至吊銷營業執照。

對依法申請人民法院強制執行的案件，要積極協調當地人民法院，按照《最高人民法院關于集中清理拖欠工程款和農民工工資案件的緊急通知》精神盡快執結。