2日，日本《朝日新聞》報道該疑云稱，負責與學園磋商國有土地交易的財務省近畿財務局制作的簽約時的審批文件與問題曝光后向國會議員出示的文件內容有出入，多處“特例”等表述消失。如果財務省認識到學園屬“特例”并進行隱瞞的話，行政扭曲的疑云將進一步加深。

“如果屬實將受到刑事處罰，是嚴重問題。”立憲民主黨干事長福山哲郎在參院預算委向政府方面進逼。

“如果屬實，內閣應當總辭職”。然而，面對步步緊逼的在野黨，日本首相安倍晉三僅回避稱“無法回答假設的提問”。

大阪地方檢察廳特搜部正在以廢棄磋商記錄文件的銷毀公文嫌疑等展開調查。財務省高層在預算委反復稱“由于難以預見會對搜查產生怎樣的影響，故不予答辯”，審議屢次中斷。

在野黨在國會之外也加強了攻勢。希望之黨代理國對委員長今井雅人5日上午通知近畿財務局將突擊造訪，稱“下午過去，希望進行應對”。有關負責人猶豫地回答“將由總省應對”，對此今井稱“總之將造訪”后掛斷了電話。

今井和立民、自由、社民各黨的代表一同造訪，直接要求出示審批文件實物，并與拒絕該要求的負責人進行了爭論。

在國會內，包括民進、共產黨在內的6個在野黨舉行了國對委員長等的會談。對于之前稱“將在6日早晨前報告事實關系調查情況”的財務省高層，立民的國對委員長辻元清美敲響警鐘稱“如果是有違期待的報告，將大大影響國會日程”，施加了壓力。

“關于財務省實施的調查，財務省將盡到說明責任。”官房長官菅義偉在記者會上試圖強調首相官邸為“第三方立場”的認識。此舉無疑是意在避免政權中樞引火燒身。

財務省也開始預設防線稱6日的報告內容將僅為“調查方針及注意事項”，隱現出事實上不會提出深入的調查報告、欲爭取時間的意圖。